Η παλινδρόμηση των ούρων είναι ως επί το πλείστον συγγενής (από κατασκευής του εμβρύου) και οφείλεται σε μία ατέλεια της ένωσης των ουρητήρων με την ουροδόχο κύστη.

Η ατέλεια αυτή προκαλεί τον πισωγυρισμό των ούρων από την κύστη στους νεφρούς ενώ αυτό απαγορεύεται.

Οι παλινδρομήσεις είναι διαφόρων βαθμών, από σταδίου Ι έως σταδίου V και ανάλογα με τη σοβαρότητα τους, μπορούν να δημιουργήσουν προβλήματα στους νεφρούς ή να συνδυάζονται με συγγενή νεφρική δυσπλασία.

Εάν η παλινδρόμηση επιμείνει ή εάν προκαλεί συνεχείς ουρολοιμώξεις παρά την καθημερινή αντιβίωση, διορθώνεται χειρουργικά.